Ministarstvo zaštite okoliša i prirode obavlja upravne i druge poslove koji se odnose na:

• opću politiku zaštite okoliša u ostvarivanju uvjeta za održivi razvitak;
• zaštitu zraka, tla, voda, mora, biljnog i životinjskog svijeta u ukupnosti uzajamnog djelovanja, osiguravanje praćenja stanja onečišćenja zraka, tla, voda i morskog okoliša te osiguravanje provedbe mjera radi sprječavanja onečišćavanja zraka, tla, voda i morskog okoliša, osiguravanje praćenja stanja te osiguravanje provedbe mjera radi sprječavanja svjetlosnog onečišćenja okoliša;
• prati stanje u vezi s uzrocima promjene klime i oštećenja ozonskog sloja, skrbi o provedbi mjera ublaženja i prilagodbe klimatskim promjenama te provodi mjere za smanjivanje tvari koje oštećuju ozonski sloj te provedbu mjera zaštite;
• izradu prijedloga mjera za unapređenje stanja u području zaštite okoliša, provedbu ciljeva zaštite okoliša utvrđenih strategijom zaštite okoliša i izradu izvješća o stanju okoliša u državi, predlaganje, promicanje i praćenje mjera za unapređivanje zaštite okoliša;
• provedbu procjene utjecaja na okoliš; osiguravanje provedbe katastra onečišćavanja;
• sustavno praćenje stanja okoliša (monitoring);
• vođenje informacijskog sustava zaštite okoliša, utvrđivanje mjera, uvjeta i suglasnosti zaštite okoliša; skrb, usklađivanje i vođenje nadzora nad financiranjem programa zaštite okoliša;
• postupanje s otpadom;
• pripremu prijedloga standarda zaštite okoliša;
• ocjenjivanje uvjeta za rad pravnih i fizičkih osoba iz područja zaštite okoliša;
• ostvarivanje međunarodne suradnje u zaštiti okoliša;
• određuje strateške odrednice održivog razvitka po konceptu zelenog gospodarstva s ciljem poticanja stvaranja dodane vrijednosti u sektoru energetike, transporta i turizma;
• utvrđivanje politike djelovanja i obavljanje upravnoga nadzora i nadzora nad stručnim radom Fonda za zaštitu okoliša i energetsku učinkovitost;
• inspekcijske poslove zaštite okoliša;
• poticanje odgoja i obrazovanja te istraživanja u svezi sa zaštitom okoliša.

Ministarstvo obavlja upravne i druge poslove koji se odnose na:

• istraživanje, proučavanje, praćenje, evidentiranje, dokumentiranje i promicanje prirodne baštine, središnju informacijsko-dokumentacijsku službu;
• utvrđivanje svojstva zaštićenih dijelova prirode te njihovo vrednovanje;
• vođenje središnjih upisnika zaštićenih dijelova prirode;
• propisivanje mjerila za utvrđivanje programa javnih potreba u području zaštite prirode Republike Hrvatske;
• skrb, usklađivanje i vođenje nadzora nad financiranjem programa zaštite prirode;
• osnivanje i nadzor nad ustanovama za obavljanje poslova djelatnosti zaštite prirode;
• ocjenjivanje uvjeta za rad pravnih i fizičkih osoba na poslovima zaštite prirode;
• osiguravanje uvjeta za obrazovanje i usavršavanje stručnih djelatnika u djelatnostima zaštite prirode, provedbu nadzora prometa, uvoza, izvoza zaštićenih dijelova prirode;
• utvrđivanje uvjeta za korištenje i namjenu zaštićenih dijelova prirode, te upravljanje zaštićenim dijelovima prirode;
• utvrđivanje uvjeta zaštite prirode; inspekcijske poslove zaštite prirode.

Ministarstvo obavlja poslove koji se odnose na sudjelovanje Republike Hrvatske u radu tijela Europske unije u područjima iz njegove nadležnosti.
Ministarstvo obavlja i druge poslove koji su mu stavljeni u nadležnost posebnim zakonom.